MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009484	CGC	2	6	187608	187613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4502	NC_009484	CCCGG	2	10	187621	187630	0 %	0 %	40 %	60 %	148259184
4503	NC_009484	ATG	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259185
4504	NC_009484	GAG	2	6	187727	187732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259185
4505	NC_009484	CGA	2	6	187733	187738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4506	NC_009484	CGC	2	6	187807	187812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4507	NC_009484	GC	3	6	187815	187820	0 %	0 %	50 %	50 %	148259185
4508	NC_009484	CGC	2	6	187843	187848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4509	NC_009484	ACG	2	6	187863	187868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4510	NC_009484	CGC	2	6	187893	187898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4511	NC_009484	GGTC	2	8	187954	187961	0 %	25 %	50 %	25 %	148259185
4512	NC_009484	GCCCGT	2	12	187976	187987	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259185
4513	NC_009484	CTG	2	6	188096	188101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4514	NC_009484	GCCC	2	8	188118	188125	0 %	0 %	25 %	75 %	148259185
4515	NC_009484	GC	3	6	188126	188131	0 %	0 %	50 %	50 %	148259185
4516	NC_009484	CGC	5	15	188203	188217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4517	NC_009484	C	6	6	188253	188258	0 %	0 %	0 %	100 %	148259185
4518	NC_009484	TCG	2	6	188259	188264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4519	NC_009484	GGCCGA	2	12	188335	188346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148259185
4520	NC_009484	GACGC	2	10	188348	188357	20 %	0 %	40 %	40 %	148259185
4521	NC_009484	CG	3	6	188394	188399	0 %	0 %	50 %	50 %	148259185
4522	NC_009484	GCA	2	6	188409	188414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4523	NC_009484	CG	3	6	188514	188519	0 %	0 %	50 %	50 %	148259185
4524	NC_009484	CTCGGC	2	12	188528	188539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259185
4525	NC_009484	TCC	2	6	188546	188551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259185
4526	NC_009484	GCC	2	6	188567	188572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4527	NC_009484	CCG	2	6	188583	188588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4528	NC_009484	TCC	2	6	188657	188662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259185
4529	NC_009484	GACC	2	8	188692	188699	25 %	0 %	25 %	50 %	148259185
4530	NC_009484	CGT	2	6	188803	188808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4531	NC_009484	CCGGC	2	10	188857	188866	0 %	0 %	40 %	60 %	148259185
4532	NC_009484	GCC	2	6	188942	188947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259185
4533	NC_009484	CAG	2	6	189017	189022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4534	NC_009484	TACC	2	8	189034	189041	25 %	25 %	0 %	50 %	148259185
4535	NC_009484	ACA	2	6	189072	189077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259185
4536	NC_009484	CTC	2	6	189089	189094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259185
4537	NC_009484	TCA	2	6	189171	189176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259185
4538	NC_009484	GCA	2	6	189189	189194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
4539	NC_009484	CGG	2	6	189307	189312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259185
4540	NC_009484	GGC	2	6	189380	189385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259185
4541	NC_009484	CTA	2	6	189532	189537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259185
4542	NC_009484	TCC	2	6	189599	189604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259185
4543	NC_009484	TCG	2	6	189671	189676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259186
4544	NC_009484	GCCG	2	8	189739	189746	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4545	NC_009484	CACG	2	8	189756	189763	25 %	0 %	25 %	50 %	148259186
4546	NC_009484	CGG	2	6	189780	189785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4547	NC_009484	AT	3	6	189825	189830	50 %	50 %	0 %	0 %	148259186
4548	NC_009484	CGA	2	6	189882	189887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259186
4549	NC_009484	CCG	2	6	190016	190021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4550	NC_009484	GCC	2	6	190070	190075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4551	NC_009484	CGC	2	6	190158	190163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4552	NC_009484	CGC	2	6	190209	190214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4553	NC_009484	GGC	2	6	190267	190272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4554	NC_009484	CGC	2	6	190278	190283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4555	NC_009484	GCCA	2	8	190297	190304	25 %	0 %	25 %	50 %	148259186
4556	NC_009484	GAA	2	6	190317	190322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259186
4557	NC_009484	TC	3	6	190332	190337	0 %	50 %	0 %	50 %	148259186
4558	NC_009484	CG	3	6	190355	190360	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4559	NC_009484	GCC	2	6	190366	190371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4560	NC_009484	GC	3	6	190405	190410	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4561	NC_009484	CGG	2	6	190446	190451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4562	NC_009484	TCACCA	2	12	190457	190468	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148259186
4563	NC_009484	GCC	2	6	190489	190494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4564	NC_009484	CGG	2	6	190512	190517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4565	NC_009484	CGT	2	6	190533	190538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259186
4566	NC_009484	GCG	2	6	190553	190558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4567	NC_009484	ACTTC	2	10	190566	190575	20 %	40 %	0 %	40 %	148259186
4568	NC_009484	GAC	2	6	190576	190581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259186
4569	NC_009484	CGA	2	6	190601	190606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259186
4570	NC_009484	CGG	2	6	190665	190670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4571	NC_009484	ACC	2	6	190675	190680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259186
4572	NC_009484	GCC	2	6	190705	190710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4573	NC_009484	CAA	2	6	190736	190741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259186
4574	NC_009484	TGGTC	2	10	190785	190794	0 %	40 %	40 %	20 %	148259186
4575	NC_009484	CGAC	2	8	190844	190851	25 %	0 %	25 %	50 %	148259186
4576	NC_009484	ACGGT	2	10	190865	190874	20 %	20 %	40 %	20 %	148259186
4577	NC_009484	GC	3	6	190949	190954	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4578	NC_009484	GCTC	2	8	190979	190986	0 %	25 %	25 %	50 %	148259186
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4584	NC_009484	GCCA	2	8	191254	191261	25 %	0 %	25 %	50 %	148259186
4585	NC_009484	CCGCG	2	10	191289	191298	0 %	0 %	40 %	60 %	148259186
4586	NC_009484	GGC	2	6	191379	191384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4587	NC_009484	CCTCAC	2	12	191394	191405	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	148259186
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4590	NC_009484	CGC	3	9	191541	191549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
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4592	NC_009484	ACC	2	6	191602	191607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259186
4593	NC_009484	CGG	2	6	191643	191648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4594	NC_009484	GCG	2	6	191650	191655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4595	NC_009484	TCCG	2	8	191678	191685	0 %	25 %	25 %	50 %	148259186
4596	NC_009484	CCG	2	6	191720	191725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
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4601	NC_009484	CGC	2	6	191889	191894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4602	NC_009484	CGC	2	6	191934	191939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4603	NC_009484	CCGC	2	8	191951	191958	0 %	0 %	25 %	75 %	148259186
4604	NC_009484	TC	3	6	192027	192032	0 %	50 %	0 %	50 %	148259186
4605	NC_009484	CGC	2	6	192066	192071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4606	NC_009484	CAT	2	6	192078	192083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259186
4607	NC_009484	CCGC	2	8	192086	192093	0 %	0 %	25 %	75 %	148259186
4608	NC_009484	CGC	2	6	192110	192115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259186
4609	NC_009484	GC	4	8	192114	192121	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4610	NC_009484	CG	3	6	192122	192127	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
4611	NC_009484	GCG	2	6	192142	192147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
4612	NC_009484	CCGGC	2	10	192167	192176	0 %	0 %	40 %	60 %	148259186
4613	NC_009484	TCG	2	6	192178	192183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259186
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4987	NC_009484	GGC	2	6	207401	207406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259202
4988	NC_009484	GTA	2	6	207408	207413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259202
4989	NC_009484	CGG	2	6	207463	207468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259202
4990	NC_009484	GC	3	6	207592	207597	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
4991	NC_009484	GGGC	2	8	207616	207623	0 %	0 %	75 %	25 %	148259203
4992	NC_009484	GCG	2	6	207624	207629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
4993	NC_009484	TCG	2	6	207632	207637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
4994	NC_009484	GCG	2	6	207690	207695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
4995	NC_009484	GCC	2	6	207755	207760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259203
4996	NC_009484	CTT	3	9	207784	207792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259203
4997	NC_009484	CGGG	2	8	207840	207847	0 %	0 %	75 %	25 %	148259203
4998	NC_009484	GCTGGC	2	12	207865	207876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259203
4999	NC_009484	GGC	2	6	207878	207883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5000	NC_009484	CGC	3	9	207906	207914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259203

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